Bioinformatika

[mladac]

[tihana]

[mladac]

kad sam ja pitala prof za promjenu vježbe odg je da mogu al da onda moram mjenjat i predavanja. mislim mogu ja doc kad hocu al to nije izgovor da se cijeloj grupi ne nadoknadi izostanak vježbi. nije mi logično da sad cijela grupa M-P dolazi kad joj se sprdne da bi mogla predat zadaću?

_________________
potpis

[fluff]

A jel netko mozda zna koja grupa danas ima vjezbe? A-f jer je trebala imati prosli utorak, na 1.maj, ili G-nekog slova jer je tak po redu?
Jer su nasoj grupi (A-F) rekli da cemo imti nadoknadu...

[Pearl]

Danas ima grupa G-LJ, ali je prof jučer na predavanjima rekao da se danas mogu predati program svi koji su ga napisali, bez obzira na to imaju li danas vježbe ili ne.

[vanja]

sto je sa grupom A-F ? Da li ce biti kakve nadoknade ?? I kako to da danas nema grupa A-F?

[kika]

[vanja]

[Geliriell]

Moze li mi netko dati optimalno poravnanje na kojem mogu provjeriti svoj program za NW a afinim gap penalom?
Npr. za HPEW i PW, je li
HPEW i _P_W ili HPEW i __PW
da se ne bi dvaput razunalo otvaranje gap penala?

Ako netko ima duzi tocno rijeseni primjer bila bih jako zahvalna.

[Pearl]

Točno rješenje za HPEW I PW je HPEW i _P_W.

[Geliriell]

Zar ne bi trebala postojati neka razlika izmedju poravnanja koje se dobije primjenom NW algoritma i NW s afinim gap penalom?

[Pearl]

Uglavnom postoji razlika, u ovom je primjeru slučajno ispalo isto poravnanje. Probaj neki drugi primjer pa ćeš vidjet.

[Geliriell]

Shvatila sam. Radi se o d-u. Kada d stavim neki veci broj od 12 poravna drugacije

[kika]

cula sam da smo skoro gotovi sa predavanjima
da li mi netko moze reci tocnu informaciju?

[marijap]

predavanja ponedjeljkom i utorkom nema od ovog tjedna (ali ima dodatnih termina u Pr1 te dane od 18-20), a možda već sutra završimo s predavanjima (MAP?), pa će se sljedeće tjedne organizirati neka vrsta predavanja (filogenetska/sufiksna stabla) samo ako će biti interesa za slušanje, tako da ljudi s instituta ruđer bošković ili biologije ne dolaze uzalud...

[kika]

a kak su organizirani ti praktikumi?
po kakvim grupama?
predala sam prva dva programa,i ne znam kad bi onda mogla predati ovaj treci.

[marijap]

možeš predati u svojem terminu vježbi kod asistentice ili pon ili uto u Pr1 od 18-20 kod prof.Goldsteina...zapravo svi primaju sve i sama izabireš kad ćeš i kome predati...najbolje što prije...

[C]

A jel zna netko kako izgleda ulazna datoteka za nepoštenu kockarnicu?
Mislim, niz je varijabilne duljine ili koliko?

Koji su alternativni treći programi?

[Debla]

niz je bilo koje duljina da..
a što se tiće trećeg programa:možeš napisat ili kockarnicu ili viterbij..

ja sam predala sve programe, šta sa upisom? ocjenom?
sva tri znaće 5? ili samo ako si predao u roku, jer ja sam svojim drugim zadatkom kasnila pola termina,tj. došla sam predat zadatak u tjednu kad ja nisam imala vježbe.. a ove druge sam predala na vrijeme, jel zna neko kako kada što? koja ocjena?

_________________

[marijap]

moraš profesora pitati za detalje oko formiranja ocjene i upisa ocjene...
u petak će u terminu predavanja biti predavanje o filogenetskim stablima (netko s instituta ruđer),
pa će vjerojatno i profesor biti prisutan...
3. program za predaje je predviđeno da bude viterbi:
kockarnica ili biološki model